В покрышке дырка так и остаётся. Если корд не повреждён, то последствий никаких не будет (чаще всего так и бывает), а если есть повреждения корда, то в районе дырки будет лёгкое вспучивание, которое со временем протрётся.
Мусор внутрь колеса не попадёт, потому что изнутри покрышку подпирает камера с приличным давлением.

Если был широкий порез, то покрышку в утиль (порез вздувается и через него вылезает камера). Если при этом ехать надо, а запасной покрышки нет, то я видел случай, когда покрышку зашивали какими-то нитками, или проволокой, или хз чем. Выглядело стрёмно, но пешим шагом и на пониженном давлении позволило доехать до цивилизации.

Прощупываешь покрышку изнутри, находишь гвоздь, удаляешь его. Дырок можешь насверлить сколько хочешь — ни на что не повлияет (если не дыра в ладонь шириной)